Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP5OP48047 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5OP48047 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms