Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPHP4O75161 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPHP4O75161 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPHP4O75161 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPHP4O75161 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NPHP4O75161 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms