Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNSO60931 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms