Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TNFSF18Q9UNG2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TNFSF18Q9UNG2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms