Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms