Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IL1RAPQ9NPH3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms