Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms