Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms