Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Q1T7F1 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Q1T7F1 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
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