Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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GABRA6Q16445 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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GABRA6Q16445 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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GABRA6Q16445 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GABRA6Q16445 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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