Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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RAB3GAP1Q15042 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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RAB3GAP1Q15042 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3GAP1Q15042 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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