Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMC1AQ14683 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
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