Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK6Q00534 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms