Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HBBP68871 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms