Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms