Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTTPP55157 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MTTPP55157 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MTTPP55157 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MTTPP55157 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MTTPP55157 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MTTPP55157 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MTTPP55157 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MTTPP55157 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTTPP55157 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTTPP55157 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTTPP55157 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTTPP55157 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTTPP55157 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTTPP55157 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTTPP55157 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTTPP55157 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTTPP55157 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms