Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYKP34925 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RYKP34925 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RYKP34925 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYKP34925 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms