Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms