Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VCLP18206 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VCLP18206 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VCLP18206 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VCLP18206 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VCLP18206 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VCLP18206 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VCLP18206 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VCLP18206 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VCLP18206 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VCLP18206 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VCLP18206 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms