Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC166P0CW27 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms