Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJA3Q9Y6H8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GJA3Q9Y6H8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJA3Q9Y6H8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJA3Q9Y6H8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJA3Q9Y6H8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms