Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP16Q9Y5T5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP16Q9Y5T5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP16Q9Y5T5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP16Q9Y5T5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms