Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIT1Q9Y3P8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIT1Q9Y3P8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIT1Q9Y3P8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms