Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3BP1Q9Y3L3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3BP1Q9Y3L3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms