Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
YBX2Q9Y2T7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YBX2Q9Y2T7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
YBX2Q9Y2T7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms