Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCA2Q9UQC9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCA2Q9UQC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLCA2Q9UQC9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms