Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SHANK2Q9UPX8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
SHANK2Q9UPX8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
SHANK2Q9UPX8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SHANK2Q9UPX8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.4 ms