Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFR2Q9UP52 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFR2Q9UP52 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFR2Q9UP52 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms