Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.51■■■□□ 2
PNMA3Q9UL41 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms