Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP8AP2Q9UKL3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP8AP2Q9UKL3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP8AP2Q9UKL3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP8AP2Q9UKL3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP8AP2Q9UKL3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP8AP2Q9UKL3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms