Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATPIF1Q9UII2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATPIF1Q9UII2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms