Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3BQ9UH17 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms