Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
CC2D2AQ9P2K1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
CC2D2AQ9P2K1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC43.81■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC43.81■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC43.77■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
CC2D2AQ9P2K1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC43.7■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC43.7■■■■■ 4.59
CC2D2AQ9P2K1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC43.69■■■■■ 4.58
CC2D2AQ9P2K1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CC2D2AQ9P2K1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CC2D2AQ9P2K1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
CC2D2AQ9P2K1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CC2D2AQ9P2K1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CC2D2AQ9P2K1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
CC2D2AQ9P2K1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
CC2D2AQ9P2K1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
CC2D2AQ9P2K1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
CC2D2AQ9P2K1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CC2D2AQ9P2K1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CC2D2AQ9P2K1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CC2D2AQ9P2K1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC43.6■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms