Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYOFQ9NZM1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYOFQ9NZM1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms