Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDL2Q9NX52 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms