Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.846e-6■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF5-212ENST00000556184 2443 ntTSL 1 (best)9.6□□□□□ -0.872e-15■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF5-211ENST00000555547 2057 ntTSL 59.4□□□□□ -0.912e-15■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-204ENST00000546630 544 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.135e-13■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6B-203ENST00000548571 223 ntTSL 49.66□□□□□ -0.865e-13■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.355e-16■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.075e-16■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 QPRT-201ENST00000219771 913 ntTSL 219.8■□□□□ 0.763e-9■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.433e-9■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.413e-9■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 QPRT-204ENST00000564967 2199 nt12.89□□□□□ -0.353e-9■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 GSTO1-204ENST00000445155 829 ntTSL 224.18■■□□□ 1.465e-10■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.545e-10■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.425e-10■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.245e-10■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 GSTO1-203ENST00000432659 592 ntTSL 23.12□□□□□ -1.915e-10■■□□□ 13.7
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.041e-9■■□□□ 13.6
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-208ENST00000549995 598 ntTSL 312.9□□□□□ -0.341e-9■■□□□ 13.6
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-210ENST00000550513 939 ntTSL 312.03□□□□□ -0.481e-9■■□□□ 13.6
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-215ENST00000551223 478 ntTSL 410.25□□□□□ -0.771e-9■■□□□ 13.6
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-205ENST00000547228 726 ntTSL 56.5□□□□□ -1.371e-9■■□□□ 13.6
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-209ENST00000550069 599 ntTSL 25.81□□□□□ -1.481e-9■■□□□ 13.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS28-202ENST00000449223 1523 ntTSL 220.35■□□□□ 0.852e-11■■□□□ 13.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.332e-11■■□□□ 13.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS28-201ENST00000417088 334 ntTSL 216.4■□□□□ 0.222e-11■■□□□ 13.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS28-204ENST00000602140 912 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.082e-11■■□□□ 13.6
APOBEC3CQ9NRW3 HSPG2-211ENST00000486901 3586 ntTSL 211.31□□□□□ -0.62e-12■■□□□ 13.6
APOBEC3CQ9NRW3 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.12e-12■■□□□ 13.6
APOBEC3CQ9NRW3 TAF15-206ENST00000603967 656 ntTSL 318.76■□□□□ 0.596e-11■■□□□ 13.6
APOBEC3CQ9NRW3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.683e-8■■□□□ 13.5
APOBEC3CQ9NRW3 RNASEH2A-204ENST00000593017 1487 ntTSL 217.85■□□□□ 0.453e-8■■□□□ 13.5
APOBEC3CQ9NRW3 UQCRC1-204ENST00000460105 622 ntTSL 216.17■□□□□ 0.183e-8■■□□□ 13.5
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPE-206ENST00000483099 967 ntTSL 221.82■■□□□ 1.081e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.151e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 USMG5-202ENST00000337003 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 USMG5-204ENST00000369815 626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.551e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPE-205ENST00000475035 532 ntTSL 1 (best)9.51□□□□□ -0.891e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPE-202ENST00000414487 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.961e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.391e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.531e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPE-204ENST00000470492 478 ntTSL 35.42□□□□□ -1.541e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.861e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.424e-10■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 ILF3-221ENST00000591649 2579 ntTSL 212.38□□□□□ -0.434e-10■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.434e-10■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 ILF3-208ENST00000587928 4230 ntTSL 210.54□□□□□ -0.724e-10■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 ILF3-205ENST00000586544 3859 ntTSL 1 (best)9.93□□□□□ -0.824e-10■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA13-205ENST00000511180 593 ntTSL 217.18■□□□□ 0.341e-14■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.134e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-219ENST00000494399 1848 ntTSL 214.18□□□□□ -0.144e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-221ENST00000636293 1102 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.374e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-222ENST00000636836 1173 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.394e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV1-220ENST00000531250 736 ntTSL 219.76■□□□□ 0.756e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV1-208ENST00000526770 1748 ntTSL 518.83■□□□□ 0.66e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.486e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.456e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.376e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.216e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV1-209ENST00000527355 679 ntTSL 216.15■□□□□ 0.186e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFV1-226ENST00000533919 774 ntTSL 316.15■□□□□ 0.186e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.888e-8■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.028e-8■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.18e-8■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.76e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLD1-206ENST00000596221 412 ntTSL 218.45■□□□□ 0.546e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLD1-209ENST00000597963 737 ntTSL 218.12■□□□□ 0.496e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.86■□□□□ 0.136e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.296e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLD1-212ENST00000600859 3474 ntTSL 212.82□□□□□ -0.366e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.386e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.46e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.416e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 HAT1-206ENST00000494601 3845 ntTSL 1 (best)9.13□□□□□ -0.956e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 HAT1-203ENST00000412731 1567 ntTSL 1 (best)8.62□□□□□ -1.036e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.426e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 COX7A2-203ENST00000377978 366 ntTSL 54.03□□□□□ -1.763e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 B2M-202ENST00000544417 933 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.415e-9■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 B2M-212ENST00000561424 604 ntTSL 310.24□□□□□ -0.775e-9■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 B2M-204ENST00000558401 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -15e-9■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 B2M-205ENST00000559220 580 ntTSL 56.12□□□□□ -1.435e-9■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 B2M-211ENST00000561139 717 ntTSL 33.61□□□□□ -1.835e-9■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.291e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.261e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 R3HDM4-204ENST00000589428 1704 ntTSL 322.82■■□□□ 1.241e-7■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.241e-10■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 SSU72-204ENST00000378726 2238 ntTSL 219.75■□□□□ 0.751e-10■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 HBM-202ENST00000472539 592 ntTSL 522.56■■□□□ 1.27e-32■■□□□ 13.4
APOBEC3CQ9NRW3 MYL4-203ENST00000536623 650 ntTSL 510.33□□□□□ -0.762e-7■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS10-203ENST00000464218 615 ntTSL 513.49□□□□□ -0.251e-9■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS10-206ENST00000494077 781 ntTSL 212.73□□□□□ -0.371e-9■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS10-204ENST00000467531 777 ntTSL 211.99□□□□□ -0.491e-9■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS10-202ENST00000344700 650 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.641e-9■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 RPS10-NUDT3-201ENST00000605528 595 ntTSL 57.46□□□□□ -1.221e-9■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 C14orf2-206ENST00000554287 361 ntTSL 34.84□□□□□ -1.632e-10■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.931e-9■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 RTN4-215ENST00000491592 860 ntTSL 24.32□□□□□ -1.721e-9■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 RTN4-213ENST00000485749 832 ntTSL 24.31□□□□□ -1.721e-9■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.112e-22■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.072e-22■■□□□ 13.3
APOBEC3CQ9NRW3 IFITM2-201ENST00000399815 382 ntTSL 314.59□□□□□ -0.072e-22■■□□□ 13.3
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