Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMC2Q9NRP2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMC2Q9NRP2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMC2Q9NRP2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.5 ms