Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NECTIN3Q9NQS3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NECTIN3Q9NQS3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms