Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PREBQ9HCU5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PREBQ9HCU5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms