Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A3Q9HAS3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC28A3Q9HAS3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms