Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C11orf49Q9H6J7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C11orf49Q9H6J7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C11orf49Q9H6J7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms