Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TNMDQ9H2S6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms