Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNF541Q9H0D2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF541Q9H0D2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF541Q9H0D2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms