Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX4Q9BYU1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX4Q9BYU1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX4Q9BYU1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX4Q9BYU1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX4Q9BYU1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX4Q9BYU1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX4Q9BYU1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX4Q9BYU1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX4Q9BYU1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX4Q9BYU1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PBX4Q9BYU1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms