Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP8

PAPPA2, Pappalysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA2Q9BXP8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PAPPA2Q9BXP8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PAPPA2Q9BXP8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPPA2Q9BXP8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPPA2Q9BXP8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms