Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWL3

C1orf43, Uncharacterized protein C1orf43, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43Q9BWL3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf43Q9BWL3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf43Q9BWL3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms