Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HIRIP3Q9BW71 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HIRIP3Q9BW71 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms