Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPPD1Q9BV87 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms