Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU70

TRMO, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMOQ9BU70 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMOQ9BU70 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMOQ9BU70 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMOQ9BU70 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMOQ9BU70 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMOQ9BU70 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMOQ9BU70 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRMOQ9BU70 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRMOQ9BU70 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194 ms