Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMKLR1Q99788 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CMKLR1Q99788 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMKLR1Q99788 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms